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DAP-seq：轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)研究新方法

更新時間：2024-08-07

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簡要描述：

DAP-seq：轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)研究新方法
DAP-Seq將蛋白質(zhì)體外表達(dá)技術(shù)與高通量測序技術(shù)相結(jié)合，不需要針對每個轉(zhuǎn)錄因子制備特異性抗體，所以DAP-Seq具有快速、高通量、節(jié)約時間成本等顯著優(yōu)勢，比ChIP-seq更易于擴(kuò)展。

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DAP-seq：轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)研究新方法

在功能基因組學(xué)和表觀遺傳學(xué)研究中，轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)（TFBS）的發(fā)掘一直是研究熱點(diǎn)。傳統(tǒng)的ChIP-seq（染色質(zhì)免疫共沉淀測序）方法，在抗體質(zhì)量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS。然而，好的抗體可遇不可求，這限制了ChIP-seq更廣泛的應(yīng)用。

DAP-seq技術(shù)的出現(xiàn)，使TFBS 的研究不再局限于物種，不再受抗體質(zhì)量的限制，為生命科學(xué)領(lǐng)域轉(zhuǎn)錄因子的研究提供了新的有效工具。

DAP-seq具有與ChIP-seq同樣的功能。通過體外蛋白表達(dá)技術(shù)，表達(dá)出帶有標(biāo)簽的轉(zhuǎn)錄因子，和基因組DNA文庫在體外進(jìn)行結(jié)合，然后分離出所有與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的DNA，再使用高通量測序，找到轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)。

藍(lán)景科信為您提供DAP-seq全流程技術(shù)服務(wù)和個性化數(shù)據(jù)分析，具有100多個物種，2000多個轉(zhuǎn)錄因子的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)。歡迎咨詢。

DAP-seq：轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)研究新方法

服務(wù)內(nèi)容：

服務(wù)項(xiàng)目	周期	交付結(jié)果
蛋白表達(dá)載體構(gòu)建	1-2周	構(gòu)建載體的測序結(jié)果實(shí)驗(yàn)過程圖原始測序數(shù)據(jù) 分析結(jié)果
蛋白無細(xì)胞表達(dá)	1-2周
DAP-seq文庫構(gòu)建	1周
DNA親和純化	1-2周
上機(jī)測序	2周
標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析	2周

已做物種：

植物
擬南芥	莖瘤芥	甘藍(lán)型油菜	白菜型油菜	不結(jié)球白菜	菜心	小麥	大麥	花生
辣椒	番茄	草莓	黃花棘豆	苦蕎	紅薯	木薯	馬鈴薯	普通煙草
人參	鴨茅	罌su	甘蔗	短芒大麥草	二色補(bǔ)血草	煙草	百脈根	芍藥
丹參	狗尾草	菠菜	玉米	大豆	高粱	藜麥	陸地棉	甜瓜
黃瓜	葡萄	灰氈毛忍冬	粉葛	三葉青	獼猴桃	香蕉	蒺藜苜蓿	紫花苜蓿
伴礦景天	苔蘚	地錢	毛果楊	717楊	84K楊	小黑楊	胡楊	山新楊
小葉楊	歐美楊	大青楊	毛白楊	剛毛檉柳	白樺	光皮樺	油松	毛竹
麻竹	銀杏	油桐	荔枝	柑橘	甜橙	歐洲云杉	核桃	柿子
閩楠	木荷	臍橙	板栗	棗	枳	杜梨	蘋果	桃
櫻桃	麻瘋樹	茶樹	梅	月季	海島棉	白木香	橡膠樹	三角褐指藻
芥藍(lán)	藍(lán)花耬斗菜	鹽芥	無花果	菠蘿	西瓜	甘薯	竹葉花椒	玫瑰

動物
驢	飛蝗	新孢子蟲	煙粉虱	草地貪夜蛾

真菌
擬輪枝鐮孢菌	豬苓真菌	意大利青霉	草酸青霉	腐霉	金黃殼囊孢	靈芝
糙皮側(cè)耳	草菇	灰蓋鬼傘	蟲草	亞洲鐮刀菌	蝗綠僵菌

細(xì)菌
路德維希腸桿菌	嗜熱厭氧桿菌	生氮假單胞菌	伯克赫爾德氏菌	布魯氏菌	肺炎克雷伯菌

相關(guān)服務(wù)：

1、凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)（EMSA）：DAP-seq后續(xù)驗(yàn)證服務(wù)。

2、酵母單雜交：DAP-seq后續(xù)驗(yàn)證服務(wù)

3、 ChIP-seq：高效檢測重組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子在基因組的結(jié)合位點(diǎn)

4、 DAP-seq與RNA-seq聯(lián)合分析：分析轉(zhuǎn)錄因子的靶基因在RNA-seq數(shù)據(jù)中的表達(dá)變化，深入挖掘DAP-seq和RNA-seq測序數(shù)據(jù)，增加轉(zhuǎn)錄組測序的分析深度。

5、 DNA-pull down：鑒定與DNA結(jié)合的蛋白。

6、精美的論文圖片設(shè)計(jì)與制作：專業(yè)設(shè)計(jì)師，設(shè)計(jì)精美論文插圖，提升論文的嚴(yán)謹(jǐn)性和美觀度。

DAP-seq：轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)研究新方法

DAP-seq是基于DNA親和純化，通過體外表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子鑒定TFBS的技術(shù)，具有不受抗體和物種限制，且高通量的優(yōu)勢，自該技術(shù)問世以來，已被廣泛應(yīng)用于轉(zhuǎn)錄調(diào)控和表觀組學(xué)的研究。能幫助您快速找到轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)，尋找轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的靶基因。